החמס, והתנועה המוסלמית של ערביי ישראל, לפי הוראות מטהרן ודמשק, מבעירים את ירושלים בניסיון למוטט את שיתוף הפעולה הביטחוני והמודיעיני האמריקני-ישראלי-פלסטיני בגדה המערבית

המקורות המודיעיניים וללוחמת טרור של תיקדבקה מדווחים, כי מלבד החומר המודיעיני המצביע על מעורבותם הישירה של איראן וסוריה במהומות. הסימן החיצוני הבולט ביותר לכך, היא העובדה כי ביום א' 4.10 בערב, ביטלה דמשק במפתיע את ביקורו של יו"ר הרשות הפלסטינית אבו מאזן בבירה הסורית, ביקור שהיה להצטרך להתקיים ביום ג' 6.10. דמשק איננה רוצה להראות ברחוב הפלסטיני כי בעיצומו של הקרב על ירושלים, היא תומכת באבו מאזן, אשר שלטונו נשען על כוחות הביטחון הישראליים, המודיעין האמריקני ה-CIA, וגדודי ביטחון פלסטיניים המאומנים והמצוידים על ידי האמריקניים.
חוגי ביטחון ישראליים בכירים אמרו ביום א' בלילה, כי למהומות מסביב להר הבית בירושלים, אשר תלכנה ותחמרנה בימים הקרובים, ישנו כל הפוטנציאל של הבערת אינתיפאדה חדשה בגדה המערבית, וכי המהומות שנערכו ביום א' מזכירות את המהומות שנערכו ב-19 בספטמבר 2000, לפני 10 שנים, בעת פריצת האינתיפאדה השנייה. גם אז היה הנושא של הר הבית ועליית יהודים עליו (אריאל שרון), הסיבה הראשית להתנגשויות, שהתפתחו אחר כך למלחמת טרור הנמשכת עד היום.
המקורות המודיעיניים של תיקדבקה מדווחים כי החלטתן של טהרן ושל דמשק להבעיר את השטח בירושלים, נובעת מהתנגדותן החריפה להסכם הפיוס שהולך ומתגבש, בתיווך מצרי, בין הפת"ח והחמס. מבחינות רבות הנשיא באשר אסד, חריף אפילו יותר בהתנגדותו להסכם מאשר האיראנים, והוא נחוש להכשילו בכל מחיר.
המקורות של תיקדבקה מוסרים כי לפי החומר המודיעיני הנמצא בידי שירותי המודיעין והביטחון הישראליים, מדובר במבצע אשר אורגן בקפדנות רבה במתכונת של מבצע צבאי לכל דבר במשך החודש האחרון, במגעים ישירים בין החמס והתנועה האיסלמית של ערביי ישראל, כאשר גורמי מודיעין איראנים וסורים מכוונים אותם. זו הפעם הראשונה ששני הארגונים האלה משתפים פעולה במבצע מהסוג הזה, דבר שהוא התפתחות חמורה ביותר מבחינתם של ישראל והרשות הפלסטינית.
המארגנים, משני הצדדים, הפעילו את מה שהם מכנים 'שיטת המורביטון' כלומר 'שומרי החומות'. לעיר העתיקה ולירושלים המזרחית הובאו, עוד לפני פרוץ המהומות, אלפי צעירים פלסטינים ישראלים ומהגדה המערבית. הם חולקו 'לפלוגות שומרי החומות', כאשר בכל קבוצה בין 150-עד 200 צעירים, אשר מקיימים משמרות 7 ימים בשבוע מסביב לשעון בתוך מסגד אל אקצא, 'כדי למנוע את כיבושו על ידי מתנחלים, גורמי הימין, ומשטרת ישראל'. משמרות אלה הפכו לגרעין המרכזי של התסיסה וההסתה בירושלים המזרחית, כאשר מידי פעם הם מגיחים בפשיטות אלימות אל סמטאות העיר העתיקה.
גורמי ביטחון ישראליים אומרים, כי אין ספק שהסיסמא של מחוללי המהומות, 'כל מי שיכול לבוא להגן על הר הבית שיגיע לשם מיד' תפסה כמו אש בשדה קוצים, בגדה המערבית, כולל בקרב תומכי הפת"ח, ובקרב ערביי ישראל.
זו היא הסיבה מדוע שוררת מתיחות שיא בירושלים לקראת ברכת הכוהנים ביום ב' 5.10, ולאחר יום של מהומות במזרח ירושלים, מזרימה משטרת ישראל תגבורות של אלפי שוטרים מכל רחבי הארץ לירושלים, כשהיא נערכת להפרות סדר גם בריכוזים של ערביי ישראל בצפון המדינה.