מפקדות חיזבאללה בביירות, והחמס בדמשק עמדו מאחורי הפיגוע בירושלים.

המקורות הצבאיים והמודיעיניים של תיקדבקה: המידע המודיעיני הנמצא בידי ישראל, בליל שבת 7.3, מראה כי המחבל שביצע את הפיגוע והרצח בישיבת מרכז הרב בירושלים שם נרצחו 8 ישראלים, עמד בקשר ונשלח על ידי מפקדות הטרור של החמס בדמשק, או חיזבאללה בביירות. עכשיו בודקים כיצד הקשר הזה בוצע, והאם היה תיאום בין דמשק וביירות. כמו כן בודקים, כיצד ניסיון של פיגוע דומה לפני כמה ימים בישיבת פורת יוסף בירושלים, שסוכל על ידי שומרים, לא הדליק מנורות אדומות אצל שירותי ומערכת הביטחון והמשטרה.
הזרוע הצבאית של החמס לקחה ביום ו' 7.3, אחריות על הפיגוע בירושלים בו נרצחו 8 תלמידי ישיבת מרכז הרב. לאחר מכן נסוג החמס מדבריו.
מקור בכיר בזרוע הצבאית אישר לקיחת אחריות זו, ואמר כי בקרוב החמס יפרסם פרטים כיצד הפעולה בוצעה. מאוחר יותר אמר דובר החמס, כי הוא לא יכול לאשר או להכחיש ידיעה זו. משפחתו של עלא הישאם אבו דהיים, בן 20, מג'באל מוכאבר, בירושלים, שביצע את הרצח, תלתה על סוכת האבלים שהקימה, את דגלי החמס וחיזבאללה. לקיחת האחריות של הזרוע הצבאית של החמס והמידע המודיעיני, מעמידה את ממשלת ישראל, וצה"ל, בפני מצב בו הם צריכים להחליט מה תהייה תגובת ישראל מול החמס על הפיגוע והרצח.
לקיחת האחריות גם סותרת את הקו הרשמי של הממשלה ומערכת הביטחון, אשר מאז הפיגוע ביום ה' 6.3, מובילים את הקו כי המדובר במפגע יחיד ובאירוע יחיד.
חוסר הביטחון בעצם נקיטת העמדה הזו ניכרו היטב ביום ו', כאשר מפכ"ל המשטרה רב ניצב דודי כהן אמר, כי הפיגוע הוא מעשה ידיו של איש יחיד שהשתמש בתעודת הזהות הכחולה שלו. אולם מיד לאחר מכן, אמר המפכ"ל, כי הכוננות העליונה נגד פיגועי טרור, תמשך גם לתוך שבוע הבא. המפכ"ל לא הסביר מדוע? ואת הסתירה בדבריו.
המקורות ללוחמת טרור של תיקדבקה מציינים, כי זה לא היה מקרה, שתחנת 'אלמנאר' של חיזבאללה, הפסיקה מיד לאחר הפיגוע את שידוריה והודיעה כי את הפיגוע ביצע ארגון 'משחררי הגליל- פלוגות עימד מורנייה, וקדושי עזה'. בישראל העדיפו עד עכשיו להתעלם מהמילים 'קדושי עזה'. 'ארגון משחררי הגליל', הוא לא ארגון קיקיוני, כפי שדווח במספר כלי תקשורת ישראליים. זה הוא השם שהחיזבאללה נתן לתשתית המודיעינית-טרוריסטית שהוא הקים בקרב ערביי ישראל בגליל, שמרכזה בכפר כנא. מאחר ותשתית זו היא העומדת מאחורי מעשי הרצח והירי, כלומר ביצוע פיגועי טרור, בחיילי צה"ל, ומשטרת ישראל, באזור הגליל, ב-5 השנים האחרונות, מאז 2003, ייתכן מאוד כי בפיגוע בירושלים, שיתפו החמס וחיזבאללה פעולה בהכנתו, כשהם משתמשים בשם התשתית שהוקמה בגליל.
הפיגוע גם הוכן ובוצע במטרה ברורה לפגוע במרכז האידיאולוגי והדתי של תנועת ההתיישבות הישראלית ביהודה, שומרון, וקודם לכן ברצועת עזה. ספק רב באם מחבל בודד היה מסוגל לבחור מטרה כזו בעצמו. גם צורת ביצוע הפיגוע, והירי, הראו כי המפגע פעל מתוך קור רוח מוחלט, כאשר הוא עובר ממטרה אחת לשנייה בצורה שיטתית. דבר המראה על הכנה ואימון מוקדמים וקפדניים ביותר.
אפשרות אחרת נוספת שנבדקת בחקירה על כוחות הביטחון היא, כי הארגון המוסלמי קיצוני, חיזב אל תחריר, לו יש נוכחות גדולה מאוד בירושלים, השתתף בהכנת הפיגוע, וביצירת הקשר שבין החמס, או חיזבאללה, ועלא הישאם אבו דהיים. המקורות של תיקדבקה מדווחים כי בשנה האחרונה הפך ארגון זה, שרק מעטים בישראל מכירים אותו, לכוח המאורגן והחזק ביותר בין ערביי מזרח ירושלים, כשהוא 'שואב' לתוכו חלק מתשתיות החמס בעיר. המהומות הקשות שהיו ביום ג' 4.3 ברחובות המרכזיים של ירושלים המזרחית, אורגנו והכוונו על ידי חיזב אל תחריר.